הסחר בין המדינות תנודתי מאוד לאורך השנים. היצוא מהווה מרכיב משמעותי בסחר הרשמי בין המדינות. ע"פ הנתונים המפורסמים מהווה יצוא הסחורות כ-98% מסך הסחר בין המדינות , בעוד היבוא הרשמי מהווה כ-2% בלבד.
היקף הסחר של ישראל ואזרבייג'ן, ללא הסחר ביהלומים, הסתכם בשנת 2016 בכ- 266 מיליון דולר, עלייה של כ- 102% בהשוואה לשנה קודמת בה הסתכם היקף הסחר בכ- 132 מיליון דולר. יצוא וכן, יבוא הסחורות רשמו במהלך 2016 עליות בהיקפם. חשוב לציין כי היצוא מהווה מרכיב משמעותי (כ-98%) בסחר הרשמי בין המדינות וכי היבוא של ישראל מאזרבייג'ן בפועל גבוה משמעותית מהיבוא הרשמי הנרשם ברשומות הסחר.
